關于在重慶9月底種植香樟樹是否能在當年發芽的問題，需要綜合考慮多個因素：

• 氣候條件：重慶屬于亞熱帶濕潤氣候區，9月底的氣溫仍然較高，且降水量適中，理論上適合植物生長。
• 土壤狀況：肥沃、排水良好的土壤有利于種子的萌發和幼苗的成長。若土壤過于黏重或貧瘠，則可能影響發芽率。
• 種子質量：優質的種子是保證高發芽率的基礎。選擇健康無病蟲害、成熟度高的種子至關重要。
• 播種方法：正確地進行播種操作（如適當深度、合理間距等）可以提高種子的存活幾率。
• 后期管理：適時適量地澆水、除草及防治病蟲害等工作也會影響香樟種子能否順利發芽。

基于以上幾點分析，在理想情況下，9月底于重慶種植香樟樹的種子是有可能在當年發芽的。具體情況還需根據實際環境變化靈活調整種植策略。以下是具體事項列表：

• 氣候條件良好
• 土壤肥沃且排水性好
• 選用優質種子
• 正確實施播種技術
• 加強后期管理工作

通過上述措施的綜合運用，可以較大程度上提升香樟樹在9月底種植后的發芽率。